L'analisi di frammenti è una tecnica di genetica molecolare basata sull'elettroforesi capillare di frammenti di DNA ottenuti tramite reazione a catena della polimerasi (PCR). I frammenti, marcati con fluorofori, vengono separati in base alla loro lunghezza attraverso un capillare e rilevati da un laser, producendo un elettroferogramma con picchi corrispondenti alle diverse dimensioni dei frammenti amplificati. Questa tecnica è impiegata principalmente per la genotipizzazione di microsatelliti, ovvero sequenze ripetute del DNA che variano tra individui, o per analizzare perdite/guadagni di porzioni cromosomiche. In ambito diagnostico, l'analisi di frammenti è utilizzata per la valutazione dell'instabilità dei microsatelliti (MSI) nei tumori del colon-retto e di altri organi, dato rilevante sia per la diagnosi della sindrome di Lynch sia per la risposta all'immunoterapia.
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