Il reparto di trapianto di cellule staminali emopoietiche è un'unità altamente specializzata che accoglie pazienti affetti da neoplasie ematologiche come leucemie, linfomi, mielomi e sindromi mielodisplastiche, che necessitano di un trattamento intensivo per consolidare la risposta ottenuta dalle terapie di induzione. La degenza nel reparto prevede diverse fasi distinte. La prima è la fase di condizionamento, in cui il paziente riceve chemioterapia ad alte dosi con l'obiettivo di eradicare le eventuali cellule tumorali residue. Successivamente viene eseguita l'infusione endovenosa delle cellule staminali emopoietiche, prelevate dal donatore compatibile (trapianto allogenico) o precedentemente raccolte dal paziente stesso (trapianto autologo). Nel periodo successivo all'infusione, il paziente attraversa una fase di aplasia midollare, in cui il sistema immunitario è gravemente compromesso: in questo periodo critico è ospitato in camere a pressione positiva con filtri HEPA per ridurre il rischio infettivo, riceve trasfusioni di supporto e profilassi anti-infettiva. Il monitoraggio intensivo degli esami ematochimici e delle eventuali complicanze è continuo per tutta la durata della degenza.