Durante un percorso di PMA vengono eseguite diverse ecografie ginecologiche per il monitoraggio della crescita follicolare, nella fase di stimolazione ovarica. Tali ecografie possono ripetersi ad intervalli stretti (ogni 2-3 giorni) fino al raggiungimento di un timing adeguato per il trigger ovulatorio. Si documentano numero e dimensione dei follicoli. Tali dati vengono correlati a dati laboratoristici circa il valore di estrogeni e progesterone circolanti, per ridurre il rischio di sindrome da iperstimolazione ovarica.
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