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L'esame colturale su materiale bioptico è un'analisi microbiologica eseguita su un frammento di tessuto ottenuto chirurgicamente o mediante biopsia percutanea. A differenza dei tamponi superficiali, la biopsia tissutale garantisce la rappresentatività del campione e riduce la contaminazione da flora saprofita. Il frammento viene processato in condizioni sterili: omogenato meccanicamente, diluito e seminato su terreni di coltura aerobici e anaerobici (agar sangue, agar cioccolato, tioglicolato), terreni per micobatteri (Löwenstein-Jensen, MGIT) e terreni per miceti (Sabouraud). L'incubazione avviene per 5-7 giorni per i batteri comuni, 6-8 settimane per i micobatteri. L'identificazione viene eseguita con spettrometria di massa MALDI-TOF e l'antibiogramma guida la terapia mirata. Le indicazioni principali comprendono l'osteomielite cronica (biopsia ossea è il gold standard per la diagnosi eziologica), l'infezione periprotesica (5-6 campioni perimplantari secondo il protocollo IDSA), l'endocardite con emocolture negative e gli ascessi profondi non drenabili.
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