L'immunofenotipizzazione con conta cellulare sul liquido di lavaggio broncoalveolare (BAL) è un'analisi citofluorimetrica specialistica che consente di caratterizzare in dettaglio le popolazioni cellulari presenti nell'alveolo polmonare, integrate dalla valutazione della cellularità totale e dal differenziale citologico. Il BAL viene ottenuto durante una broncoscopia a fibre ottiche flessibili: il broncoscopio viene incuneato in un bronco subsegmentale del lobo interessato e, dopo instillazione di soluzioni fisiologiche sterili (volume totale 100–300 mL), il liquido di lavaggio viene recuperato per aspirazione. Il campione di BAL viene poi processato in laboratorio per la citologia (valutazione del numero totale di cellule, della quota di macrofagi, linfociti, neutrofili, eosinofili e mastociti) e per l'immunofenotipizzazione: le cellule vengono incubate con un pannello di anticorpi monoclonali fluorescenti fino a 8 marcatori CD (tipicamente CD3, CD4, CD8, CD19/CD20, CD16/CD56) e analizzate con citometria a flusso. Il rapporto CD4/CD8 è un parametro chiave: un valore elevato (>3,5) è caratteristico della sarcoidosi polmonare; un rapporto invertito (<1) è tipico della polmonite da ipersensibilità (alveolite allergica estrinseca) nella fase acuta e di alcune polmoniti interstiziali. Una linfocitosi BAL con fenotipo monoclonale B può indicare un linfoma a cellule B con interessamento polmonare. L'esame è indispensabile nel percorso diagnostico delle interstiziopatie polmonari diffuse (ILD) e delle infezioni polmonari opportunistiche nei pazienti immunocompromessi.