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La ricerca degli acidi nucleici dei plasmodi della malaria mediante PCR (Polymerase Chain Reaction) è un esame di biologia molecolare per la diagnosi dell'infezione malarica con elevata sensibilità (rileva parassitemie fino a 1-5 parassiti/µl di sangue, contro i 50-100 della microscopia) e specificità per l'identificazione della specie. Il DNA del plasmodio viene estratto da un campione di sangue intero (EDTA) e amplificato con PCR in tempo reale utilizzando primer specifici per il genere Plasmodium (screening) e per le singole specie: P. falciparum (il più pericoloso, responsabile della malaria grave), P. vivax, P. ovale, P. malariae e P. knowlesi. L'esame è indicato quando la microscopia (striscio sottile e goccia spessa) è negativa o dubbia in pazienti con febbre di ritorno da aree endemiche, per l'identificazione precisa della specie (fondamentale per la scelta terapeutica: P. vivax e P. ovale richiedono la terapia con primachina per le forme epatiche ipnozoiti), per le infezioni miste e per il monitoraggio della clearance parassitaria durante la terapia.
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