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La ricerca degli acidi nucleici del virus TBE (Tick-Borne Encephalitis) è un esame di biologia molecolare per la diagnosi diretta dell'infezione da virus dell'encefalite da zecca, un flavivirus trasmesso dalla puntura di zecche Ixodes ricinus nelle aree endemiche dell'Europa centrale e settentrionale (in Italia principalmente Trentino-Alto Adige, Friuli Venezia Giulia, Veneto). Il test utilizza la RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction) per amplificare e rilevare l'RNA virale in campioni di sangue o liquor cerebrospinale. La viremia è transitoria e presente nella prima fase dell'infezione (fase febbrile pre-neurologica), mentre nella fase meningoencefalica il virus è raramente rilevabile nel sangue. La ricerca nel liquor è più utile nella fase neurologica. L'esame è indicato quando la presentazione clinica (febbre bifasica, cefalea, meningismo, encefalite) e l'anamnesi epidemiologica (puntura di zecca in area endemica) suggeriscono TBE e la sierologia è ancora negativa o in fase di sieroconversione. Il test molecolare consente una diagnosi precoce.
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