La ricerca degli acidi nucleici del virus West Nile è un esame di biologia molecolare per la diagnosi dell'infezione da West Nile virus (WNV), un flavivirus trasmesso dalla puntura di zanzare del genere Culex. L'RNA virale viene ricercato nel sangue (plasma o siero), nel liquor cerebrospinale e nelle urine mediante RT-PCR real-time. La viremia è transitoria (1-2 settimane dall'infezione) e il test molecolare è positivo nelle fasi precoci, prima della comparsa degli anticorpi IgM. L'80% delle infezioni è asintomatico; circa il 20% presenta la febbre di West Nile (febbre, cefalea, mialgie, rash), e meno dell'1% sviluppa la forma neuroinvasiva (meningite, encefalite, paralisi flaccida acuta simil-poliomielitica). L'esame è indicato nei pazienti con meningoencefalite nella stagione estivo-autunnale (periodo di attività delle zanzare), nella paralisi flaccida acuta, nello screening dei donatori di sangue e di organi nelle aree endemiche e nella sorveglianza epidemiologica. La ricerca nelle urine può prolungare la finestra diagnostica molecolare rispetto al sangue.
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