La ricerca degli acidi nucleici di Neisseria gonorrhoeae su tampone oculare è un esame di biologia molecolare per la diagnosi della congiuntivite gonococcica, un'infezione oculare grave causata dal diplococco Gram-negativo N. gonorrhoeae. Il campione viene prelevato con un tampone sterile dalla congiuntiva palpebrale inferiore, evitando di toccare le ciglia e la cute periorbitaria. Il DNA viene estratto e amplificato con PCR real-time per i geni specifici del gonococco (opa, porA). La congiuntivite gonococcica si presenta con secrezione purulenta abbondante, edema palpebrale e iperemia congiuntivale intensa. Nell'adulto è conseguenza dell'autoinoculazione da infezione genitale o del contatto con secrezioni infette. Nel neonato (ophthalmia neonatorum) l'infezione viene acquisita durante il passaggio nel canale del parto e si manifesta 2-5 giorni dopo la nascita. Senza trattamento tempestivo con antibiotici (ceftriaxone intramuscolare) la cheratite ulcerativa può portare alla perforazione corneale e alla cecità. L'esame molecolare è più sensibile della coltura e fornisce risultati in poche ore.