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La ricerca degli acidi nucleici di Mycobacterium tuberculosis complex mediante PCR (Polymerase Chain Reaction) è un esame di biologia molecolare che amplifica e rileva specifiche sequenze di DNA del complesso M. tuberculosis (M. tuberculosis, M. bovis, M. africanum). Il test può essere eseguito su un'ampia varietà di campioni biologici: espettorato, lavaggio broncoalveolare, aspirato gastrico, liquido cerebrospinale, urine, biopsie tissutali, aspirato linfonodale e liquido pleurico. I sistemi automatizzati di ultima generazione (GeneXpert, Hain) forniscono il risultato in 2-4 ore e possono simultaneamente rilevare le mutazioni genetiche associate alla resistenza alla rifampicina. La PCR è particolarmente utile nei pazienti con sospetto clinico di tubercolosi e microscopia negativa per bacilli acido-resistici, nella tubercolosi extrapolmonare (meningite tubercolare, tubercolosi ossea, linfoadenite) e nei pazienti immunodepressi. L'esame colturale su terreni solidi e liquidi resta comunque necessario per l'antibiogramma completo.
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