La raccolta corretta evita contaminazione eccessiva: tampone rettale inserito oltre la linea anale, gola dopo evitare antisettici locali nelle ore precedenti se possibile, urina dopo astinenza minima urinaria secondo protocollo laboratorio. Esito positivo implica terapia combinata secondo linee guida regionali con attenzione alle resistenze a cefalosporine di terza generazione. I partner sessuali degli ultimi 60 giorni vanno valutati e trattati per bloccare la catena di trasmissione. In gravidanza la diagnosi precoce riduce rischio di oftalmia neonatale e artrite settica. Il NAAT non sostituisce sempre la coltura quando necessario antibiogramma fenotipico. Spesso sullo stesso campione si ricerca Chlamydia trachomatis.
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