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La parotite acuta può dipendere da virus (es. orecchioni) o altre eziologie; la conferma molecolare orienta quarantena scolastica o lavorativa e consigli vaccinali. Il campione deve essere raccolto precocemente nella malattia per massimizzare la resa della PCR. In contesti epidemici il laboratorio può eseguire tipizzazione. Pazienti con immunodepressione o segni sistemici gravi necessitano valutazione clinica oltre al test. L'interpretazione integra sierologia e quadro epidemiologico. Complicanze rare (orchite, pancreatite, encefalite) richiedono monitoraggio ospedaliero indipendentemente dal risultato del singolo tampone. Nei vaccinati contro gli orecchioni la PCR può risultare negativa in fase tardiva: correlare sempre con clinica, esame delle ghiandole salivari e eventuale sierologia.
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