Il campione viene raccolto durante speculoscopia evitando contaminazione eccessiva da flora vaginale; si inserisce il tampone nel canale cervicale ruotandolo. Esiti falsamente negativi possono comparire con carica batterica bassa o campione insufficiente. Un esito positivo richiede terapia antibiotica combinata secondo linee guida regionali, tenendo conto delle resistenze emergenti ai fluorochinoloni. I partner sessuali devono essere valutati e trattati per evitare ping-pong di reinfezione. In gravidanza la diagnosi precoce riduce rischio di corioamnionite e congiuntivite neonatale. Il test NAAT non sostituisce sempre la coltura quando serve antibiogramma per fallimento terapeutico. Spesso si richiede sullo stesso prelievo anche ricerca di Chlamydia trachomatis.