La ricerca di parassiti in materiale biologico diverso da sangue e feci è un esame parassitologico specializzato eseguito su campioni come biopsie tissutali, espettorato, lavaggio broncoalveolare, liquido pleurico, urine, raschiati cutanei, umor acqueo o vitreo, biopsie muscolari e frammenti di ectoparassiti. L'analisi comprende diverse metodiche a seconda del tipo di campione e del parassita sospettato: l'esame microscopico diretto a fresco permette di individuare forme mobili di protozoi; le colorazioni specifiche (Giemsa, tricromica, Ziehl-Neelsen modificata) evidenziano strutture parassitarie altrimenti invisibili; le tecniche di concentrazione aumentano la sensibilità. Per i raschiati cutanei si ricercano acari della scabbia (Sarcoptes scabiei), larve di miasi e Demodex. Nell'espettorato e nel lavaggio broncoalveolare si cercano uova di elminti polmonari (Paragonimus) e larve di Strongyloides. Nelle biopsie si identificano cisti di protozoi tissutali (Leishmania, Toxoplasma) e forme larvali di elminti (Echinococcus, Trichinella). Il referto descrive la presenza o assenza di forme parassitarie e, quando possibile, l'identificazione della specie per impostare la terapia antiparassitaria specifica.